Şu anda FK Zalgiris Vilnius takımında 14 numaralı formayı giyerek oynuyor. Genellikle Savunmacı pozisyonunda oynar.

UEFA Youth League 2024-2025 sezonu boyunca Martynas Šetkus, forma giydiği 2 maçta maç başına ortalama 5.5 müdahale, 1.5 top kapma ve 1.5 uzaklaştırma yaparken, maç başına 0 şut blokladı.