Saat ini ia bermain untuk KS Dinamo Tirana, mengenakan kaus bernomor 93. Ia bermain terutama sebagai Gelandang. Kaki yang diutamakan adalah Kiri. Nilai pasar saat ini diperkirakan sebesar 350K €.

Perpindahan terakhirnya adalah dari KF Dukagjini ke FC Dinamo City pada 2025-07-01.

Dalam 24 penampilan di Liga Super Albania 2025-2026, Faton Neziri mencatatkan 1 gol dan 0 assist, sambil menyelesaikan 0 umpan kunci dari total 0 umpan dengan akurasi passing -.