Actualmente juega para el CSD Antofagasta, con el dorsal 25. Juega principalmente en la posición de Portero. Su pie preferido es el Derecho. Su valor de mercado actual se estima en 50K €.

Su último movimiento fue un del Antofagasta U19 al CSD Antofagasta el 2019-12-31.

En la temporada 2026 de la Liga de Ascenso de Chile, Juan cisternas jugó 2 partidos, con un promedio de 0 intercepciones, 0 entradas y 0 despejes por partido.